Yuuki Cross yang ceria dan Zero Kiryuu yang kasar adalah anggota komite disiplin di Akademi Cross, yang memiliki dua kelas yang sangat berbeda: Kelas Siang dan Kelas Malam. Tugas mereka adalah menjaga ketertiban antara kedua kelas saat mereka berganti. Meskipun tugas itu mungkin tidak terlihat terlalu sulit, Kelas Siang tidak mengetahui kebenaran di balik Kelas Malam—siswa-siswa mereka yang sangat cantik adalah vampir.

Sepuluh tahun yang lalu, Yuuki diselamatkan dari serangan vampir oleh Kaname Kuran, seorang vampir Pureblood. Kini, Kaname menjadi pemimpin Kelas Malam, dan posisi Yuuki di komite disiplin memungkinkan dia untuk bertemu dengannya lagi, membuat perasaannya terhadapnya menjadi rumit. Sementara itu, Zero menyimpan kebencian yang membara terhadap semua vampir dan percaya bahwa mereka tidak pernah bisa hidup harmonis dengan manusia. Namun, rahasia dari masa lalu Zero segera mengancam kedamaian rapuh di akademi, dan segalanya mungkin tidak akan pernah sama lagi.