Ken Kaneki akhirnya menerima sisi mengerikan dan haus darah yang selama ini ia takuti dan benci. Setelah lolos dari penahanan dan penyiksaan, Kaneki bergabung dengan Pohon Aogiri—organisasi ghoul militan yang telah menculiknya, membuat teman-temannya mempertanyakan motif dan kesetiaannya yang sebenarnya.

Seiring meningkatnya ketegangan antara pemerintah dan para ghoul, Komisi Anti-Ghoul, badan anti-ghoul khusus pemerintah, telah mengintensifkan upaya mereka untuk membersihkan Tokyo sepenuhnya dari para ghoul. Hal ini mengancam kedamaian sementara teman-teman dan mantan rekan Kaneki—para ghoul di kedai kopi Anteiku. Menyadari situasi berbahaya ini, Kaneki menghadapi beberapa pertempuran yang mempertaruhkan kemanusiaannya yang berharga dan fana.