Terjebak bersama ribuan orang di The New Gate, sebuah permainan realitas virtual, pemain elit Shinya Kiritani memutuskan untuk menyelesaikan permainan dan akhirnya pulang. Namun, setelah ia berhasil mengalahkan bos terakhir seorang diri, Shinya dipindahkan ke dunia baru—yang tampaknya tidak dapat dibedakan dari dunia yang baru saja ia tinggalkan.

Shinya menemukan bahwa selama menu permainan dan keahliannya tidak berubah, ia tidak dapat meninggalkan dunia yang anehnya familiar ini. Dalam pencariannya untuk keluar dari penjara dimensi baru ini, Shinya bertemu dengan Tiera Lucent, seorang resepsionis hotel yang kebetulan adalah anak didik Schnee Raizar—salah satu mantan anggota kelompok Shinya. Dengan secercah harapan ini, Shinya berusaha untuk bersatu kembali dengan Schnee dan mencari tahu kebenaran tentang The New Gate.