Bagi siswa sekolah menengah atas seperti Shouichi Kamita, ujian masuk universitas dan masa depan adalah hal yang umum menjadi perhatian. Pada masa ini pula, emosi misterius yang mengganggu orang-orang dari segala usia mungkin mulai membebani pikiran seseorang-cinta.

Pada masa remajanya ini, Shouichi menemukan tiga gadis yang ia lihat memiliki masa depan bersamanya: Hikari Tsuneki yang selalu ceria, yang selalu menggoda Shouichi tanpa belas kasihan, tetapi sebenarnya memiliki sisi yang lebih lembut; pemain game yang kompetitif, Tooru Miyamae, yang mengalami kesulitan untuk berkomunikasi dengan orang lain; dan teman masa kecil Shouichi, Kyouko Touno, seorang penggemar manga shoujo yang terkadang tidak dewasa. Seiren mengikuti hubungan Shouichi dengan ketiga gadis ini dalam tiga alur cerita yang berbeda, ketika perasaan mereka tumbuh dari ketertarikan yang sama dan berkembang menjadi sesuatu yang lebih indah.