Takashi Natsume telah terbiasa dengan pertemuannya dengan youkai melalui Book of Friends, yang berisi nama-nama youkai yang disegel oleh neneknya, Reiko Natsume, dalam kontrak. Pertemuan ini memungkinkan Natsume untuk lebih memahami youkai, Reiko, dan dirinya sendiri. The Book of Friends adalah alat yang ampuh yang dapat digunakan untuk mengendalikan youkai; itu dicari oleh youkai dan pengusir setan sama-sama. Natsume hanya ingin menjalani kehidupan sehari-harinya dengan damai tetapi terus-menerus terganggu oleh pengalaman-pengalaman ini. Jika dia ingin mengakhiri siksaan ini, Natsume harus mengeksplorasi lebih banyak tentang buku dan dunia pengusiran setan, serta mulai membuka hatinya untuk mereka yang dapat membantunya.