Saat sedang mencari-cari di loteng kakeknya, Hikaru Shindou menemukan papan go kuno. Saat menyentuhnya, ia disambut oleh suara misterius, dan tak lama kemudian pingsan. Ketika ia sadar kembali, ia menyadari bahwa suara tersebut masih ada dan milik Fujiwara no Sai, roh seorang ahli go kuno. Sebagai instruktur go untuk Kaisar Jepang pada era Heian, kecintaan Sai terhadap permainan ini melampaui batas waktu dan ruang, memungkinkan dia untuk terus memainkan permainan kesayangannya sebagai entitas hantu. Tujuan akhir Sai adalah menguasai teknik go ilahi yang belum pernah dicapai oleh pemain mana pun, dan dia berusaha mencapainya dengan memainkan permainan papan melalui Hikaru.

Meskipun tidak tertarik pada permainan papan, Hikaru dengan enggan setuju untuk bermain, mengikuti instruksi Sai dalam melakukan langkah-langkah. Namun, ketika ia bertemu dengan jenius catur muda Akira Touya, hasratnya terhadap permainan tersebut perlahan-lahan terbangkitkan. Terinspirasi oleh rival barunya, perjalanan Hikaru ke dunia catur baru saja dimulai.