Yuugo Hachiken adalah seorang yang rajin belajar, pekerja keras, dan lelah berusaha memenuhi ekspektasi yang tidak dapat ia penuhi. Dengan dimulainya tahun ajaran baru, dia memutuskan untuk mendaftar di SMA Pertanian Ooezo, sebuah sekolah asrama yang terletak di pedesaan Hokkaido, sebagai sarana untuk melepaskan diri dari tekanan yang ditimbulkan oleh orang tuanya.

Awalnya yakin bahwa dia akan berhasil di institusi ini, Hachiken dengan cepat terbukti salah oleh teman-teman sekelasnya yang berbakat, orang-orang yang telah hidup di pertanian sepanjang hidup mereka dan mengetahui hampir semua hal dalam hal makanan, sayuran, dan bahkan fisiologi ternak! Entah itu bangun jam lima pagi untuk melakukan pekerjaan berat atau merawat hewan ternak, Hachiken benar-benar seorang amatir dalam hal kehidupan pertanian yang keras.

Gin no Saji mengikuti kisah komedi seorang siswa muda yang mencoba menyesuaikan diri dengan lingkungan yang sama sekali baru, dan bertemu dengan banyak orang yang unik di sepanjang jalan. Saat dia berjuang untuk menghargai lingkungannya, Hachiken berharap dapat menemukan mimpinya, sehingga dia dapat menjalani kehidupan yang memuaskan dengan caranya sendiri.