“e-Pulse,” yang dihasilkan oleh pikiran dan emosi manusia, digunakan sebagai sumber energi untuk perangkat pendukung AI “Sapotama.” Dari bayang-bayang perkembangan luar biasa ini, monster-monster mengerikan muncul. Digimon adalah makhluk hidup yang berevolusi dengan mengonsumsi e-Pulse.

Tomoro Tenma terhanyut dalam pengalaman luar biasa setelah bertemu Gekkomon, yang tiba-tiba muncul dari Sapotama-nya. Saat tinggal bersama Kyo Sawashiro dan anggota tim pemburu hadiah “Golden Dawn” lainnya, Tomoro memperbarui tekadnya. Masa depan baru apa yang akan dibentuk oleh manusia dan Digimon?