Setelah kejatuhan terakhir Bakugan Naga yang jahat, kedamaian kembali ke Vestroia. Dengan bantuan Danma Kuusou, rekannya Pyrus Dragonoid, dan Jagoan Pertempuran lainnya, Infinity dan Silent Core digabungkan dan dunia diciptakan kembali.

Namun, New Vestroia tidak akan diberi kelonggaran saat penjajah alien humanoid, Vestals, tiba dan menaklukkan dunia Bakugan dalam satu gerakan. Dipersenjatai dengan mesin menakutkan yang mampu membatasi Bakugan ke dalam bentuk bola, mereka bertujuan untuk memperbudak ras tersebut sebagai bentuk hiburan.

Sekarang, satu-satunya kekuatan yang menghalangi mereka adalah Perlawanan Petarung Pertempuran Bakugan-sekelompok manusia, Bakugan, dan Vestal yang menentang gagasan untuk memusnahkan ras berakal budi. Dipimpin oleh Danma, mereka harus menjelajah ke New Vestroia yang diduduki musuh dan mengusir penjajah, untuk memastikan kelangsungan hidup seluruh dunia.