Cerita dimulai dengan pertarungan antara dua pahlawan yang saling bersaing, ZET dan ALPHAS, dan kemudian menelusuri asal-usul mereka – Jin Kanzaki, seorang pemuda yang memiliki kemampuan untuk berubah menjadi manusia super yang dikenal sebagai ZET, dan Kouga Amagi, seorang pemuda yang memiliki rasa keadilan yang tinggi yang menggunakan teknologi untuk bertarung sebagai ALPHAS.

Nasib kedua orang ini dan orang-orang di sekitar mereka saling terkait saat mereka berjuang untuk melindungi umat manusia dan menghancurkan kekejian mengerikan yang dikenal sebagai Players.