Daikichi Kawachi adalah seorang bujangan berusia 30 tahun yang memiliki pekerjaan terhormat, tetapi mengembara tanpa tujuan dalam hidupnya. Ketika kakeknya tiba-tiba meninggal dunia, dia kembali ke rumah keluarganya untuk memberikan penghormatan terakhir. Setibanya di rumah tersebut, ia bertemu dengan seorang gadis muda misterius bernama Rin yang, yang membuat Daikichi tercengang, adalah putri haram kakeknya!

Gadis pemalu dan tidak bisa didekati ini dianggap memalukan bagi keluarga, dan mendapati dirinya dikucilkan oleh kerabat ayahnya, semuanya menolak untuk merawatnya setelah kematiannya. Daikichi, yang marah atas sikap dingin mereka terhadap Rin, mengumumkan bahwa ia akan mengasuh Rin-meskipun ia adalah seorang pria lajang yang masih muda dan tidak memiliki pengalaman mengasuh anak.

Usagi Drop adalah kisah perjalanan Daikichi menjadi seorang ayah yang membesarkan Rin dengan sifatnya yang lembut dan penuh kasih sayang, serta eksplorasi kehangatan dan saling ketergantungan yang merupakan inti dari sebuah keluarga yang bahagia dan erat.