Kogorou Akechi adalah pendiri firma investigasi swasta yang dikenal sebagai Klub Detektif Anak Laki-laki. Bersama-sama, kelompok ini menangani kasus-kasus besar dan kecil. Salah satu anggota junior mereka, Kensuke Hanasaki, sedang menyelesaikan sebuah kasus pada suatu hari ketika dia bertemu dengan Yoshio Kobayashi, seorang bocah laki-laki amnesia yang misterius dan tidak bisa mati. Setelah melihat kemampuannya beraksi, Kensuke menawarkan Yoshio sebuah kesepakatan: bergabunglah dengan Klub Detektif Anak Laki-laki dan bantu mereka memecahkan kasus, dan sebagai gantinya, dia akan menemukan cara untuk membantu Yoshio mati.

Yoshio yang apatis menerima kesepakatan ini dengan berat hati, tanpa menyadari betapa berbedanya kehidupannya kelak. Meskipun dia tidak banyak berguna bagi orang lain, dia secara bertahap mulai mengakui kelompok ini karena dia menghabiskan lebih banyak waktu dengan mereka saat memecahkan kasus.

Penipu Edogawa Ranpo “Shounen Tanteidan” yori mengikuti Akechi dan anggota Klub Detektif Anak laki-laki lainnya saat mereka memecahkan berbagai kasus yang diberikan kepada mereka, sambil memerangi ancaman tersembunyi dari bayang-bayang – “Iblis Berwajah Dua Puluh.”