Di hari pertamanya di sekolah menengah pertama, Eren Yeager berhadapan langsung dengan seekor titan-dan makan siangnya dicuri! Sejak hari itu, dia menyimpan dendam kepada para titan karena telah mengambil makanan kesukaannya, burger keju, dan bersumpah untuk memusnahkan mereka untuk selamanya. Bersama dengan adik angkatnya, Mikasa Ackerman, dan teman mereka, Armin Arlert, ketiganya menjelajahi lorong-lorong SMP Titan, bertemu dengan wajah-wajah yang tidak asing lagi dan berpartisipasi dalam berbagai kegiatan ekstrakurikuler sebagai bagian dari Klub Pembersihan Tembok.

Sebuah parodi dari serial orang tua yang sangat populer, Shingeki! Kyojin Chuugakkou menempatkan karakter-karakter yang dicintai sebagai murid-murid sekolah menengah pertama, yang berjuang untuk melindungi makan siang mereka dari para raksasa yang rakus.