Dengan berakhirnya Kejuaraan Interhigh, tim basket Seirin memfokuskan kembali upaya mereka, berlatih lebih keras dari sebelumnya untuk mendapatkan kesempatan berpartisipasi di Piala Musim Dingin. Baik Tetsuya Kuroko maupun Taiga Kagami melihat teman-teman lama kembali ke dalam kehidupan mereka, memberikan tantangan baik di dalam maupun di luar lapangan.

Seiring dengan berkembangnya kemampuan baru dan terciptanya aliansi baru, musuh-musuh dari berbagai tim-raksasa bola basket sekolah menengah seperti Yousen, Shuutoku, dan Touou-menghalang-halangi upaya gigih Seirin untuk mencapai puncak. Semua sekolah ini terbukti menjadi musuh yang tangguh yang kemampuannya berkembang secara eksponensial, sementara Kuroko berjuang untuk menemukan keseimbangan antara tekadnya untuk bermain sebagai bagian dari tim dan keinginannya untuk menang.

Dengan luka lama yang terbuka kembali, tantangan baru yang harus dihadapi di lapangan, dan serangkaian musuh baru – “Raja Tak Bermahkota” – yang bersumpah untuk mengalahkan para calon baru, akankah Seirin dapat mencapai impian mereka untuk mengalahkan Generasi Keajaiban?