Di sebuah desa yang ramai dengan makhluk halus, Yuzu, seorang gadis rubah yang ceria, memulai pekerjaan pertamanya sebagai pelayan di penginapan pemandian air panas tradisional Konohanatei. Meskipun Yuzu tidak memiliki pengalaman bekerja di tempat berkelas, Kiri, kepala pelayan yang ramah dan dapat diandalkan, segera menugaskan Yuzu untuk mempelajari dasar-dasarnya.

Meskipun pada awalnya semangat Yuzu terbukti lebih banyak menjadi penghalang daripada berkah, sifatnya yang ceria membawa pesona unik ke penginapan, karena para pelanggan dan rekan-rekan kerjanya dengan cepat menjadi akrab dengan kesalahannya yang kikuk namun memiliki tujuan yang baik. Di bawah bimbingan rubah-rubah lainnya – Satsuki yang kaku, Natsume yang riang, Ren yang kritis, dan Sakura yang pendiam – Yuzu dengan mantap mempelajari pekerjaan sebagai pelayan penginapan sambil belajar untuk mencintai dunia sihir di sekelilingnya.

Konohana Kitan menyajikan kisah mengharukan tentang gadis rubah sederhana yang menjalin ikatan dengan orang lain dan menemukan rumah di tengah-tengah dunia roh yang misterius dan indah.