Sebagai ungkapan terima kasih kepada para pahlawan dari seri .hack//Sign dan .hack, Helba telah menyiapkan acara khusus bagi semua karakter untuk menemukan “Twilight Hot Springs” yang baru didirikan. Para karakter dapat menikmati istirahat dan relaksasi yang pantas mereka dapatkan dengan berendam di pemandian air panas yang menakjubkan, tetapi ada satu masalah—pemandian air panas tersebut tersembunyi, dan telah terjadi pembunuhan misterius terhadap para pemain. Dengan petunjuk tunggal berupa kata “GIFT,” perlombaan pun dimulai untuk menemukan pelaku dan lokasi pemandian air panas tersebut.