Petugas Pasukan Bela Diri Jepang (JSDF) yang sedang tidak bertugas dan otaku Youji Itami sedang dalam perjalanan untuk menghadiri konvensi doujin di Ginza, Tokyo ketika sebuah portal misterius berbentuk gerbang besar tiba-tiba muncul. Dari gerbang ini, makhluk-makhluk gaib dan para pejuang berbaju zirah abad pertengahan muncul, menyerbu ke seluruh penjuru kota, membunuh dan menghancurkan apa saja yang menghalangi jalan mereka. Dengan tindakan cepat, Youji menyelamatkan sebanyak mungkin nyawa yang ia bisa, sementara anggota JSDF lainnya mengarahkan upaya mereka untuk menghentikan invasi tersebut.

Tiga bulan setelah serangan tersebut, Youji ditugaskan untuk memimpin tim pengintai khusus, sebagai bagian dari gugus tugas JSDF, yang akan dikirim ke dunia di luar gerbang-sekarang disebut sebagai “Wilayah Khusus”. Mereka harus melakukan perjalanan ke dunia yang tidak dikenal ini untuk mempelajari lebih lanjut tentang apa yang mereka hadapi dan mencoba berteman dengan penduduk setempat dengan harapan dapat menciptakan hubungan damai dengan kekaisaran yang berkuasa. Namun, jika mereka gagal, mereka akan menghadapi konsekuensi untuk berpartisipasi dalam perang dahsyat yang akan melanda kedua belah pihak.