Saat menjalankan misi untuk menemukan dan mengalahkan penyihir yang merepotkan, beberapa anggota guild Fairy Tail terpecah di sebuah kota yang tidak dikenal. Di saat yang sama, Haru, Elie, dan anggota kelompok mereka yang lain juga terpisah. Dalam sebuah kejadian yang beruntung, Elie bertemu dengan Lucy dan Happy, yang sedang mencari Natsu. Sementara itu, Haru bertemu dengan Natsu yang sedang berjuang melawan mabuk perjalanan. Meskipun dia tampak ramah, Elie cocok dengan deskripsi pengacau yang ditugaskan untuk ditemukan oleh anggota Fairy Tail. Lebih buruk lagi, Natsu mengetahui hubungan Haru dengannya dan mencurigai mereka sebagai kaki tangan.

Dalam crossover antara dua seri populer ini, Fairy Tail x Rave mengikuti kedua kelompok saat mereka menemukan kesamaan satu sama lain. Ketika miskomunikasi bertambah, mereka diadu satu sama lain dalam adu kekuatan yang sengit, tetapi harus bekerja sama untuk melawan musuh bersama.