Di Stadion Touto, pertandingan sepak bola J. League sedang berlangsung. Saat itu, Detektif Kogorou Mouri menerima ancaman bom dari penelepon yang tidak dikenal dan sebuah teka-teki misterius yang menunjukkan lokasinya. Conan Edogawa sekarang harus menyelamatkan para penggemar game ini sebelum waktunya habis.

Untungnya, dengan tindakan cepat dan pemikiran cerdas Conan, bom tersebut ditemukan dan ledakan dapat dihindari. Pelakunya tidak berhenti sampai di situ; Detektif Kogorou diberitahu tentang bom lain yang disembunyikan dan siap meledak di sebuah acara besar di kota. Terpaksa berpacu dengan waktu, dengan ribuan nyawa yang dipertaruhkan, Conan harus memecahkan teka-teki lain, menemukan lokasi bom, dan menangkap pelakunya untuk menghindari tragedi yang mengerikan.