Cerita ini berkisah tentang Valt Aoi dan Shu Kurenai serta rekan-rekan satu tim mereka, Rantaro Kiyama, Daina Kurogami dan Wakiya Komurasaki di sekolah Akademi Beigoma di Jepang. Ketika tidak sedang belajar, para sahabat ini terobsesi dengan Beyblade mereka, membentuk klub Bey di sekolah di akhir musim dan menantang satu sama lain untuk bertarung di Stadion Bey mereka. Para sahabat ini akhirnya menjadi rival yang bersahabat saat mereka bersaing satu sama lain dalam sebuah kompetisi untuk merebut gelar Blader terbaik di Jepang.