Berdasarkan permainan peran aksi sekolah COLOPL. Berlatar belakang tahun 2045. Dunia telah terkontaminasi oleh Irousu (penjajah misterius yang tiba-tiba muncul), dan manusia mendapati diri mereka dibatasi dan terkungkung. Yang berdiri dengan berani melawan para penjajah ini adalah gadis-gadis biasa di mana-mana, tanpa tentara yang kuat atau bahkan senjata.

Akademi Gadis Shinjugamine adalah sekolah untuk para “Hoshimori” (Penjaga Bintang) yang ditakdirkan untuk melawan Irousu. Pemain ditugaskan di akademi ini untuk melatih para gadis dan mengambil kembali Bumi yang terkontaminasi. Maka, sekali lagi, lonceng bergema di halaman sekolah yang dipenuhi sinar matahari untuk menandai dimulainya kelas hari ini…